La fiscalización se realiza a través de la división de Control y Faenamiento dependiente de la dirección de Gestión Ambiental, con el apoyo de las divisiones de Salubridad e Higiene, Fiscalización Tributaria y de agentes de la Policía Municipal de Tránsito (PMT). Los recientes controles se realizaron en Ciudad Nueva, mercado de abasto, 5 ½ La Blanca y Fortín Toledo. Los locales comerciales que no presentaron las documentaciones correspondientes fueron suspendidos, y tendrán que acercarse hasta la Municipalidad a presentarlos para ser habilitados de nuevo. El control se realiza con relación a la cadena de frío o certificación del Servicio Nacional de Calidad y Salud Animal (SENACSA), para ser derivados al juzgado de falta para su sanción correspondiente si los comercios no adecuan la comercialización a las condiciones requeridas. Una vez notificado el propietario deberá presentar el documento de habilitación correspondiente.